El Museo de las Culturas de Oaxaca forma parte del Centro Cultural Santo Domingo, compuesto por el Templo de Santo Domingo, el jardín histórico etnobotánico, la biblioteca Fray Francisco de Burgoa y la hemeroteca pública de Oaxaca Néstor Sánchez.
Se encuentra en la parte alta del ex-convento y cuenta con 14 salas de exposiciones permanentes y 13 salas temáticas, que, a través de piezas rudimentarias, obras de arte y vestigios arqueológicos, ofrecen al visitante un panorama de 10 mil años de historia del estado de Oaxaca; desde los primeros asentamientos sedentarios y el florecimiento de las grandes culturas prehispánicas, pasando por la conquista y la colonia, la época de la Independencia, hasta llegar al siglo XX.
El Museo está integrado por las siguientes salas: Culturas Milenarias (10000 a.c. - 200 d.c.); Tiempos de Florecer (200 - 900 d.c.); Los Tesoros de la Tumba 7; Los Señoríos (900 - 1521 d.c.); Contacto y Conquista (siglo XVI); Conquista Espiritual del Pasado (siglos XVI al XVII); Respuestas Indígenas (siglos XVI al XVIII); Materia y Espíritu (siglos XVI al XVIII); Surgimiento de la Nueva Nación (fines del siglo XVIII - mediados del XIX); Orden y Progreso (1876 - 1911); Imágenes del Siglo XX; La Vida Comunal Indígena (época actual); Rehaciendo el Círculo Comunitario (época actual); y Santo Domingo: Historia y Hallazgos (siglos XVI - XX).
Entre las salas V y VII se encuentran 13 pequeños espacios interactivos donde se pueden tocar algunos elementos y obtener información apoyada en la tecnología multimedia.
Abierto de martes a domingo de 11:00 a 20:00 hrs. La entrada tiene un costo de recuperación.